Dez anos se passaram desde o fim do Bakumatsu, uma era de guerra que viu a revolta de cidadãos contra o xogunato Tokugawa. Os revolucionários queriam criar um tempo de paz e um país próspero, livre da opressão. A nova era Meiji chegou, mas a paz ainda não foi alcançada. Espadas são proibidas, mas pessoas ainda são assassinadas nas ruas. Órfãos de veteranos de guerra são deixados sem ter para onde ir, enquanto o governo parece contente em apenas encher seus bolsos de dinheiro.
Um samurai errante, Kenshin Himura, ainda trabalha para garantir que os valores pelos quais lutou valham as vidas gastas para trazer a nova era. Outrora conhecido como Hitokiri Battousai, ele era temido como o assassino mais implacável de todos os revolucionários. Agora assombrado pela culpa, Kenshin jurou nunca mais matar em expiação pelas vidas que tirou, e talvez nunca conheça a paz até que matar seja uma coisa do passado.
Agora, no 11º ano de Meiji, Kenshin se depara com Kaoru Kamiya, dona e instrutora principal de um pequeno dojo ameaçado de fechar as portas. A força policial é impotente para impedir a série de assassinatos cometidos em nome de seu dojo por um homem que alega ser o famoso Battousai. As andanças de Kenshin param por enquanto, enquanto ele se junta a Kaoru para limpar o nome de ambos. Mas quanto tempo ele pode ficar antes que seu passado o alcance?
OBS: Capítulo 223-255 estão em português de Portugal irei atualizar quando sair novos capítulos em pt-br.
